Szudán már korábban jelezte, hogy nem engedélyezi a kettős állampolgárságot azoknak a dél-szudániaknak, akik az elszakadás után továbbra is északon maradnak. Azoknak a dél-szudániak, akik dolgozni szeretnének Szudánban, előbb hivatalos munkavállalási és letelepedési engedélyt kell kérniük Kartúmtól. A szudáni kormány 9 hónap haladékot ad az országban maradt délieknek, hogy döntsenek a státuszukról. Azokat, akik a dél-szudáni állampolgárságot választják, megfosztják a szudáni állampolgárságuktól.
A Szudánban élő déliek 58%-a vett részt az elszakadásról kiírt referendumon. Az ENSZ adatai szerint jelenleg több mint egymillió déli él Szudánban, akik közül október óta 360 ezren tértek vissza Dél-Szudánban. Sok északon élő déli azért döntött a maradás mellett, mert szeretné megtartani a munkáját.