Germain Katanga 2004-ben részt vett a Kongói DK keleti körzeteiben zajló harcokban. Itt jelentős területeket foglalt el egy Ugandából érkezett és onnan támogatott fegyveres szervezet. A helyi, kongói önvédelmi milíciákat a kinshasai kormány támogatta. Az egyik általuk végrehajtott sikeres katonai akciót viszont valami olyasmi követte, ami vállalhatatlan volt a kongói kormány számára. Bogoro falu visszafoglalása után 366 embert lemészároltak, mert azzal vádolták őket, hogy együttműködtek az ugandai agresszorokkal. Germain Katanga is részese volt a bűntettnek, bár nem közvetlen elkövetőként, hanem csak előkészítőként. 2007-ben elfogták és a kongói kormány kiadta az ENSZ nemzetközi bíróságának. A hosszú per során 57 tanút hallgattak meg és Katangát bűnösnek találták tömeggyilkosságban való közreműködésben. Ezért most 12 évre ítélték, de ebből lejön a már előzetesben eltöltött idő. A bíróság azt is figyelembe vette, hogy Katanga láthatóan megbánta tetteit és minden tekintetben segítette a vizsgálatot. Az utolsó szó jogán azt mondta, nagyon megváltozott, amikor milicistaként harcolt fejben még gyerek volt, a per során vált igazán felnőtté. A bogorói mészárlás tényleges elkövetői egyébként sosem kerültek kézre és a Kongói DK keleti részén ma is harcok folynak a hadsereg és a helyi, illetve a külföldi eredetű milíciák között.