Az MSF azzal indokolta döntését, hogy a munkatársai komoly veszélynek vannak kitéve, folyamatosan támadás éri őket. Az MSF több mint 1500 munkatársa dolgozott Szomáliában, hogy segítsenek a rászorulókon. Az MSF volt az egyik legnagyobb és egyben az egyik leghatékonyabban működő szervezet az országban. Számos olyan területre is sikerült segélyeket eljuttatniuk, ahova más szervezetek nem tudtak eljutni. Az MSF elsősorban gyógyszereket és oltóanyagokat osztott szét a szomáliai lakosság körében. Emellett több tucat egészségügyi központot is létrehoztak, ahol komolyabb műtéteket is el lehetett végezni. Az MSF bejelentése mindenkit váratlanul ért, mivel a szervezet híres volt arról, hogy a legextrémebb helyeken is képes hatékonyan működni.
Szomáliában 1991 óta tart a polgárháború. Az MSF 22 év alatt 16 munkatársát veszítette el az országban. A lázadók számtalanszor megtámadták az általuk üzemeltetett egészségügyi központokat és a segélyeket szállító konvojaikat. Az MSF kivonulása mindenképen komoly veszteség Szomáliának és a jelenlegi központi vezetésnek, amely két éve azért küzd, hogy stabilizálja az ország biztonsági helyzetét. De eddig ez nemigen sikerült.