Quettaban kapta el a pakisztáni titkosszolgálat, amely átadta őt a CIA-nak. A bagrami támaszpontra vitték Afganisztánba. Ott a kihallgatók a hírek szerint meglehetősen brutális módszereket alkalmaznak az információk megszerzése céljából. Juszuf Al Mauritani nagyon jelentős tisztségre emelkedett az Al Kaidan belül. Letartóztatása idején ő koordinálta az Al Kaida akcióit Észak-Amerika, Európa és Ausztrália területén. A parancsokat közvetlenül Oszama Bin Ladentől kapta.
Mauritánia már régen nemzetközi elfogatóparancsot adott ki Juszuf Al Mauritani ellen. Azzal gyanúsítják, hogy 2005-ben ő irányította azt a terrorakciót, amely 17 katona életébe került Mauritániában. 2008-ban egy másik terrorakció során egy rendőr meghalt és két dzsihád harcos is életét veszítette Nouakchott-ban. Mauritánia kedvelt bázisa az Al Kaida észak- afrikai szárnyának: a sivatagi területeken a hírek szerint kiképző táborokat tartanak fenn és fenyegető közleményeiket rendszeresen Mauritániában bejegyzett honlapokon juttatják el a nagyvilágba.