A Protillos-szigeten tervezett csatorna, amely az új óceánközi viziút része, megváltoztathatja a folyó természetes medrét és ennek a kivizsgálását kéri Costa Rica kormánya a nemzetközi szervezettől. A munkálatok a folyó medrének megváltoztatása mellett visszavonhatatlan környezeti károkt okoz az adott körzetben, amelynek hatása nem csak Nicaraguában, hanem a szomszédos Costa Ricában is érezhető változásokat okoz majd. A Portillos szigeten végzett munkálatokra Costa Rica úgy tekint, hogy azzal suylosan megsérti az ország szuverenitását – hangsúlyozták abban a dokumentumban, ameylet a costa-ricai fél a bíróság elé tárt. Mint olyan ország, amelynek nincs hadserege, kérjük a nemzetközi törvényszék segítségét nemzeti jogaink megvédése érdekében – hangsúlyozzák.
Nicaragua, amely teljes szuverenitást gyakorol a San Juan határfolyó felett, a costa-ricai aggodalmakra válaszul beszüntette a két kérdéses csatorna építési munkálatait, de nem mondott le annak megépítéséről. Nicaraguai vélemények szerint a szomszédos ország aggodalmai mgalapozatlanok, hiszen az említett gondok elhárítására Nicaragua megtette a szülséges lépéseket – amelyek a másik fél szerint nem megfelelőek. Az ügy most a bíróság döntésére vár.
A tervek szerint a Nicaraguai óceán-közi csatorna egy, a Panama-csatornánál szélesebb, az Atlanti- és a Csendes-óceánt összekötő víziút megaprojektjének keretében két mélytengeri kikötő, egy olajvezeték, két repülőtér és egy vasútvonal is épülne a mintegy 40 milliárd dollárnyi kínai tőkéből. A Panama-csatornával szemben alternatívát kínáló “óceánközi” vízi út megépítése már a függetlenség kivívása óta nagy álma a közép-amerikai országnak. Már Augusto Sandino (1895-1934), a legendás forradalmár és szabadságharcos is javasolta a hajózható vízi út megépítését.