Kainerugaba 1998 óta szolgál a hadseregben és jelenleg a legerősebb különleges alakulat parancsnoka. Museveni bírálói szerint a fia a korához képest rendkívül gyorsan menetel felfelé a ranglétrán. A kormány közleményében azzal indokolta Kainerugaba újabb „ugrását”, hogy Museveni elnök elrendelte a különleges alakulatok összevonását. Ezért egységes parancsnokságot alakított ki, amit a Muhoozi Kainerugaba fog vezetni.
Museveni elnök 1986 óta van hatalmon. Az ellenzéki pártok azzal vádolják, hogy élete végéig elnök akar maradni és ezért törölte el az elnöki mandátumok számát korlátozó törvényt. Angelo Izama politológus szerint az ugandai hadseregen belül elkezdődött a politika utódlás előkészítése. Izama szerint Muhoozi a magasabb beosztást és nagyobb felelősséget kapott. Ami könnyen átvezetheti majd a politika világába. A kormányzópártnak jól jöhet ugyanis majd a jövőben egy olyan elnökjelölt, aki bírja a hadsereg támogatását.
A Különleges Alakulatok Parancsnokság látja majd el, a VIP személyek védelmét és a stratégiai fontosságú épületek ellenőrzését. Az ország nyugati régiójában található olajmezőket is a különleges egységek fogják felügyelni.