Az ellenzéki politikus azzal indokolta döntését, hogy az országot továbbra is a régi rezsim irányítja. Ezért a lelkiismerete nem engedi, hogy induljon az elnöki székért, amíg nincs valódi demokrácia. A béke Nobel-díjas liberális politikus az egyik leghangosabb kritikusa a katonai vezetésnek Egyiptomban. Szerinte a hadsereg arra készül, hogy bebetonozza hatalmát és továbbra is megőrizze befolyását az ország ügyeinek intézésében. Álláspontja szerint a tábornokok nem jó irányba kormányozzák az országot és elárulták a forradalmat. Baradei úgy látja, az ország következő elnökének nem lesz valódi hatalma, a rezsim magába szippantja. A törvényhozási választások eddigi eredményei azt mutatják, hogy az iszlamisták csaknem kétharmados többséget szereztek, a liberálisok pedig gyengén szerepeltek. A nemzetközileg ismert és elismert el-Baradei a hazájában nem tudott vezéregyéniséggé válni.